Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A1P68400 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms