Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNB1P62873 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms