Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP25P60880 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms