Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP4BP1P59074 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHMP4BP1P59074 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms