Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NUP107P57740 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP107P57740 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms