Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBASH3AP57075 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms