Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIK1P57059 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIK1P57059 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIK1P57059 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIK1P57059 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIK1P57059 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SIK1P57059 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIK1P57059 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SIK1P57059 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms