Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GSCP56915 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSCP56915 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GSCP56915 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSCP56915 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms