Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRPF1P55201 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms