Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NAPAP54920 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NAPAP54920 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NAPAP54920 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NAPAP54920 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms