Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 IRC23YOR044W 474 nt1.83□□□□□ -2.12
HEF3P53978 LAA1YJL207C 6045 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 RTR1YER139C 681 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 RPS20YHL015W 366 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YIL102CYIL102C 306 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YAR053WYAR053W 297 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YBL073WYBL073W 312 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 IRR1YIL026C 3453 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 TFC8YPL007C 1767 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 SSK2YNR031C 4740 nt1.82□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YBP1YBR216C 2025 nt1.81□□□□□ -2.12
HEF3P53978 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.81□□□□□ -2.12
HEF3P53978 HHT1YBR010W 411 nt1.81□□□□□ -2.12
HEF3P53978 SWI5YDR146C 2130 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 MCM22YJR135C 720 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 BIL1YOR304C-A 231 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 LHS1YKL073W 2646 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 PIP2YOR363C 2991 nt1.8□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YIL059CYIL059C 366 nt1.79□□□□□ -2.12
HEF3P53978 PAU18YLL064C 363 nt1.79□□□□□ -2.12
HEF3P53978 PAU6YNR076W 363 nt1.79□□□□□ -2.12
HEF3P53978 FMP23YBR047W 528 nt1.79□□□□□ -2.12
HEF3P53978 HDA3YPR179C 1968 nt1.78□□□□□ -2.12
HEF3P53978 OSH6YKR003W 1347 nt1.78□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.78□□□□□ -2.12
HEF3P53978 YCL046WYCL046W 324 nt1.78□□□□□ -2.12
HEF3P53978 VPS15YBR097W 4365 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 PXA2YKL188C 2562 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 SWI6YLR182W 2412 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 TBS1YBR150C 3285 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 NOP53YPL146C 1368 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YNL144CYNL144C 2223 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.77□□□□□ -2.13
HEF3P53978 PAC1YOR269W 1485 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 MSH6YDR097C 3729 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 EFR3YMR212C 2349 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YHL041WYHL041W 450 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 IRE1YHR079C 3348 nt1.76□□□□□ -2.13
HEF3P53978 PKH3YDR466W 2697 nt1.75□□□□□ -2.13
HEF3P53978 CCH1YGR217W 6120 nt1.75□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YGR250CYGR250C 2346 nt1.74□□□□□ -2.13
HEF3P53978 MSC6YOR354C 2079 nt1.74□□□□□ -2.13
HEF3P53978 PMD1YER132C 5262 nt1.74□□□□□ -2.13
HEF3P53978 ZRG17YNR039C 1818 nt1.73□□□□□ -2.13
HEF3P53978 CTR9YOL145C 3234 nt1.73□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YGR265WYGR265W 411 nt1.73□□□□□ -2.13
HEF3P53978 MAK10YEL053C 2202 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 HIR3YJR140C 4947 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 SGO1YOR073W 1773 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 SEC63YOR254C 1992 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 MDM20YOL076W 2391 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 CYC7YEL039C 342 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 ABM1YJR108W 372 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 YJR039WYJR039W 3366 nt1.72□□□□□ -2.13
HEF3P53978 LYS14YDR034C 2373 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 MRPL31YKL138C 396 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YAF9YNL107W 681 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 NUT2YPR168W 474 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YLR422WYLR422W 5799 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 RLM1YPL089C 2031 nt1.71□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 ZIP1YDR285W 2628 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 UPS1YLR193C 528 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 TIM18YOR297C 579 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 SAR1YPL218W 573 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YPL225WYPL225W 441 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YBR174CYBR174C 315 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 FRK1YPL141C 2598 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 RFX1YLR176C 2436 nt1.7□□□□□ -2.14
HEF3P53978 HMI1YOL095C 2121 nt1.69□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.69□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YOP1YPR028W 543 nt1.69□□□□□ -2.14
HEF3P53978 RKM1YPL208W 1752 nt1.69□□□□□ -2.14
HEF3P53978 SLY1YDR189W 2001 nt1.68□□□□□ -2.14
HEF3P53978 CSN9YDR179C 489 nt1.68□□□□□ -2.14
HEF3P53978 STF2YGR008C 255 nt1.68□□□□□ -2.14
HEF3P53978 RPL40BYKR094C 387 nt1.68□□□□□ -2.14
HEF3P53978 MSH5YDL154W 2706 nt1.68□□□□□ -2.14
HEF3P53978 TRM732YMR259C 4263 nt1.67□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YKL136WYKL136W 399 nt1.67□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YGR130CYGR130C 2451 nt1.66□□□□□ -2.14
HEF3P53978 MUK1YPL070W 1839 nt1.66□□□□□ -2.14
HEF3P53978 SRP14YDL092W 441 nt1.66□□□□□ -2.14
HEF3P53978 YDR102CYDR102C 333 nt1.66□□□□□ -2.14
HEF3P53978 snR51snR51 107 nt1.66□□□□□ -2.14
HEF3P53978 PAU3YCR104W 375 nt1.65□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YJR011CYJR011C 786 nt1.65□□□□□ -2.15
HEF3P53978 TRX1YLR043C 312 nt1.65□□□□□ -2.15
HEF3P53978 RPL38YLR325C 237 nt1.65□□□□□ -2.15
HEF3P53978 HUG1YML058W-A 207 nt1.65□□□□□ -2.15
HEF3P53978 RPL35AYDL191W 363 nt1.64□□□□□ -2.15
HEF3P53978 YKL118WYKL118W 312 nt1.64□□□□□ -2.15
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