Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YPR153WYPR153W 423 nt0.51□□□□□ -2.33
GIM3P53900 ISD11YER048W-A 285 nt0.5□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.5□□□□□ -2.33
GIM3P53900 APL2YKL135C 2181 nt0.5□□□□□ -2.33
GIM3P53900 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
GIM3P53900 DBP6YNR038W 1890 nt0.5□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.49□□□□□ -2.33
GIM3P53900 UPS1YLR193C 528 nt0.49□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.49□□□□□ -2.33
GIM3P53900 PAC1YOR269W 1485 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YDR220CYDR220C 294 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 RPC10YHR143W-A 213 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 SDH2YLL041C 801 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 LCD1YDR499W 2244 nt0.48□□□□□ -2.33
GIM3P53900 PAN2YGL094C 3348 nt0.47□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
GIM3P53900 YGL015CYGL015C 393 nt0.46□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YIL059CYIL059C 366 nt0.46□□□□□ -2.34
GIM3P53900 snR84snR84 550 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YFR057WYFR057W 456 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YPT6YLR262C 648 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 RRT1YBL048W 312 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 WAR1YML076C 2835 nt0.45□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.43□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.43□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.43□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YPR096CYPR096C 303 nt0.43□□□□□ -2.34
GIM3P53900 POP7YBR167C 423 nt0.43□□□□□ -2.34
GIM3P53900 SWI6YLR182W 2412 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YOR248WYOR248W 303 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YAR009CYAR009C 3591 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 MET32YDR253C 576 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 PRE4YFR050C 801 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 CWC23YGL128C 852 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YLR271WYLR271W 825 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 CSM4YPL200W 471 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YLL032CYLL032C 2478 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM3P53900 YGR115CYGR115C 780 nt0.4□□□□□ -2.35
GIM3P53900 SLI15YBR156C 2097 nt0.4□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YGR228WYGR228W 345 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM3P53900 ABF2YMR072W 552 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YOR282WYOR282W 321 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YGR042WYGR042W 816 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YHL042WYHL042W 453 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM3P53900 URM1YIL008W 300 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM3P53900 BFR2YDR299W 1605 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YMR160WYMR160W 2451 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM3P53900 IQG1YPL242C 4488 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM3P53900 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM3P53900 SPC2YML055W 537 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM3P53900 PMP1YCR024C-A 123 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM3P53900 SDS22YKL193C 1017 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM3P53900 CHS6YJL099W 2241 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM3P53900 snR5snR5 204 nt0.35□□□□□ -2.35
GIM3P53900 RFX1YLR176C 2436 nt0.34□□□□□ -2.35
GIM3P53900 NPC2YDL046W 522 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YGL230CYGL230C 444 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 OST1YJL002C 1431 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YJR079WYJR079W 330 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 MRPL31YKL138C 396 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 UBS1YBR165W 834 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM3P53900 NOP9YJL010C 2001 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM3P53900 RPL9AYGL147C 576 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM3P53900 GMC2YLR445W 567 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM3P53900 MLP2YIL149C 5040 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM3P53900 COG4YPR105C 2586 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM3P53900 RPL32YBL092W 393 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM3P53900 VAM3YOR106W 852 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM3P53900 LOA1YPR139C 903 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YCL002CYCL002C 792 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM3P53900 GEA2YEL022W 4380 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM3P53900 MRPL32YCR003W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM3P53900 SPO11YHL022C 1197 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM3P53900 RCN2YOR220W 798 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM3P53900 FMP27YLR454W 7887 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YJR003CYJR003C 1560 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM3P53900 INA22YIR024C 651 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM3P53900 RPL26AYLR344W 384 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YOR029WYOR029W 336 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM3P53900 YOR218CYOR218C 420 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM3P53900 BEM3YPL115C 3387 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM3P53900 NPR2YEL062W 1848 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM3P53900 GPG1YGL121C 381 nt0.27□□□□□ -2.37
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