Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOSBP53539 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOSBP53539 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms