Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LBX1P52954 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LBX1P52954 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LBX1P52954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LBX1P52954 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LBX1P52954 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LBX1P52954 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LBX1P52954 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms