Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP98P52948 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP98P52948 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP98P52948 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP98P52948 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP98P52948 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP98P52948 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms