Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK7P50613 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK7P50613 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK7P50613 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK7P50613 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms