Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSEN2P49810 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSEN2P49810 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms