Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PXNP49023 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PXNP49023 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PXNP49023 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PXNP49023 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PXNP49023 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PXNP49023 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms