Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCLMP48507 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCLMP48507 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms