Protein–RNA interactions for Protein: P47976

CTH1, mRNA decay factor CTH1, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTH1P47976 MET5YJR137C 4329 nt2.93□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YCL019WYCL019W 5313 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 MPT5YGL178W 2580 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 PAA1YDR071C 576 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 RTC6YPL183W-A 282 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 VMA9YCL005W-A 222 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 SOK1YDR006C 2706 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 SGD1YLR336C 2700 nt2.92□□□□□ -1.94
CTH1P47976 YGR050CYGR050C 357 nt2.91□□□□□ -1.94
CTH1P47976 MDV1YJL112W 2145 nt2.91□□□□□ -1.94
CTH1P47976 CMC4YMR194C-B 222 nt2.91□□□□□ -1.94
CTH1P47976 LCL1YPL056C 306 nt2.91□□□□□ -1.94
CTH1P47976 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.9□□□□□ -1.95
CTH1P47976 GRX8YLR364W 330 nt2.9□□□□□ -1.95
CTH1P47976 PSO2YMR137C 1986 nt2.9□□□□□ -1.95
CTH1P47976 HYP2YEL034W 474 nt2.89□□□□□ -1.95
CTH1P47976 BOI1YBL085W 2943 nt2.89□□□□□ -1.95
CTH1P47976 RLI1YDR091C 1827 nt2.89□□□□□ -1.95
CTH1P47976 NPR3YHL023C 3441 nt2.89□□□□□ -1.95
CTH1P47976 DIA2YOR080W 2199 nt2.88□□□□□ -1.95
CTH1P47976 NCA2YPR155C 1851 nt2.88□□□□□ -1.95
CTH1P47976 FAS1YKL182W 6156 nt2.88□□□□□ -1.95
CTH1P47976 OST4YDL232W 111 nt2.88□□□□□ -1.95
CTH1P47976 ZRG17YNR039C 1818 nt2.88□□□□□ -1.95
CTH1P47976 MPH1YIR002C 2982 nt2.87□□□□□ -1.95
CTH1P47976 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.87□□□□□ -1.95
CTH1P47976 PUF4YGL014W 2667 nt2.87□□□□□ -1.95
CTH1P47976 YJL070CYJL070C 2667 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 MAK21YDR060W 3078 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 RSN1YMR266W 2862 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 AHC1YOR023C 1701 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 SDC25YLL016W 3147 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 YOR055WYOR055W 435 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 KSP1YHR082C 3090 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 VPS34YLR240W 2628 nt2.86□□□□□ -1.95
CTH1P47976 PDR11YIL013C 4236 nt2.85□□□□□ -1.95
CTH1P47976 GIS1YDR096W 2685 nt2.85□□□□□ -1.95
CTH1P47976 MRD1YPR112C 2664 nt2.85□□□□□ -1.95
CTH1P47976 YDL196WYDL196W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
CTH1P47976 TIM11YDR322C-A 291 nt2.85□□□□□ -1.95
CTH1P47976 SAK1YER129W 3429 nt2.84□□□□□ -1.95
CTH1P47976 GRR1YJR090C 3456 nt2.84□□□□□ -1.95
CTH1P47976 YLR149CYLR149C 2193 nt2.84□□□□□ -1.95
CTH1P47976 BNR1YIL159W 4128 nt2.84□□□□□ -1.95
CTH1P47976 SAP190YKR028W 3102 nt2.84□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YAT2YER024W 2772 nt2.83□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.83□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YBR174CYBR174C 315 nt2.83□□□□□ -1.96
CTH1P47976 RIF1YBR275C 5751 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 SOM1YEL059C-A 225 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YBR206WYBR206W 324 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 FIG4YNL325C 2640 nt2.82□□□□□ -1.96
CTH1P47976 GIP3YPL137C 3831 nt2.81□□□□□ -1.96
CTH1P47976 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.81□□□□□ -1.96
CTH1P47976 MGM1YOR211C 2646 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YCL046WYCL046W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 HOS4YIL112W 3252 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 PXA2YKL188C 2562 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YDR239CYDR239C 2364 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 MSC6YOR354C 2079 nt2.8□□□□□ -1.96
CTH1P47976 SWI6YLR182W 2412 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 HAL9YOL089C 3093 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 snR62snR62 100 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YDL242WYDL242W 354 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 CDC31YOR257W 486 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 YPL044CYPL044C 549 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 CYR1YJL005W 6081 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 IRC20YLR247C 4671 nt2.79□□□□□ -1.96
CTH1P47976 SET2YJL168C 2202 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 SNF5YBR289W 2718 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 ESC1YMR219W 4977 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 HUG1YML058W-A 207 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 EDS1YBR033W 2760 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 SEF1YBL066C 3447 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 HSH155YMR288W 2916 nt2.78□□□□□ -1.96
CTH1P47976 PSK1YAL017W 4071 nt2.78□□□□□ -1.97
CTH1P47976 CTF4YPR135W 2784 nt2.78□□□□□ -1.97
CTH1P47976 MLH1YMR167W 2310 nt2.77□□□□□ -1.97
CTH1P47976 PBY1YBR094W 2262 nt2.77□□□□□ -1.97
CTH1P47976 YBL012CYBL012C 402 nt2.77□□□□□ -1.97
CTH1P47976 SIR4YDR227W 4077 nt2.77□□□□□ -1.97
CTH1P47976 AIM44YPL158C 2277 nt2.77□□□□□ -1.97
CTH1P47976 AI2Q0055 2565 nt2.76□□□□□ -1.97
CTH1P47976 ROM1YGR070W 3468 nt2.76□□□□□ -1.97
CTH1P47976 YNL144CYNL144C 2223 nt2.76□□□□□ -1.97
CTH1P47976 RPL42BYHR141C 321 nt2.76□□□□□ -1.97
CTH1P47976 KRE33YNL132W 3171 nt2.75□□□□□ -1.97
CTH1P47976 SPO75YLL005C 2607 nt2.75□□□□□ -1.97
CTH1P47976 PEP3YLR148W 2757 nt2.75□□□□□ -1.97
CTH1P47976 NOC3YLR002C 1992 nt2.75□□□□□ -1.97
CTH1P47976 SLY1YDR189W 2001 nt2.75□□□□□ -1.97
CTH1P47976 RFX1YLR176C 2436 nt2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.3 ms