Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CHRNA4P43681 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms