Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPD2P43304 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPD2P43304 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPD2P43304 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPD2P43304 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms