Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL35P42766 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL35P42766 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL35P42766 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms