Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 UFD2YDL190C 2886 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 PAN3YKL025C 2040 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 VPS54YDR027C 2670 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 RPL40BYKR094C 387 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 FYV7YLR068W 456 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 PBI2YNL015W 228 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 snR13snR13 124 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 snR189snR189 189 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YPR063CYPR063C 423 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 PAU24YBR301W 363 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 SWI5YDR146C 2130 nt0.94□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YDR509WYDR509W 348 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 AIM29YKR074W 468 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 CLU1YMR012W 3834 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YOR376WYOR376W 369 nt0.93□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 BIG1YHR101C 1008 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 HDA3YPR179C 1968 nt0.92□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YCR001WYCR001W 315 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT2P39981 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT2P39981 MXR1YER042W 555 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT2P39981 PHS1YJL097W 654 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT2P39981 MUK1YPL070W 1839 nt0.91□□□□□ -2.26
AVT2P39981 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YDL211CYDL211C 1119 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YGR045CYGR045C 363 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YGR265WYGR265W 411 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 RAD50YNL250W 3939 nt0.9□□□□□ -2.27
AVT2P39981 PAU2YEL049W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 RPL16AYIL133C 600 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 NFU1YKL040C 771 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YML108WYML108W 318 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 TOM22YNL131W 459 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YOP1YPR028W 543 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 CDC39YCR093W 6327 nt0.89□□□□□ -2.27
AVT2P39981 SEC5YDR166C 2916 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YJR003CYJR003C 1560 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YGL217CYGL217C 342 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 PAU12YGR294W 363 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 URM1YIL008W 300 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YNL122CYNL122C 348 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 RPL32YBL092W 393 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 TIM18YOR297C 579 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 snR14snR14 160 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 LOA1YPR139C 903 nt0.88□□□□□ -2.27
AVT2P39981 TOF2YKR010C 2316 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 SLX4YLR135W 2247 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 MKT1YNL085W 2493 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 RTR1YER139C 681 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 NBL1YHR199C-A 222 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YLL020CYLL020C 306 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YBL073WYBL073W 312 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 SWI4YER111C 3282 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 GDS1YOR355W 1569 nt0.87□□□□□ -2.27
AVT2P39981 PXA2YKL188C 2562 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT2P39981 STB6YKL072W 2301 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YDR008CYDR008C 351 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.86□□□□□ -2.27
AVT2P39981 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 BI2Q0110 1272 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 RUF22RUF22 515 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 snR41snR41 95 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 BUD3YCL014W 4911 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 ZIP1YDR285W 2628 nt0.85□□□□□ -2.27
AVT2P39981 NUT1YGL151W 3399 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YHR130CYHR130C 336 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT2P39981 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.84□□□□□ -2.27
AVT2P39981 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.28
AVT2P39981 SEC3YER008C 4011 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 LYS14YDR034C 2373 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 SGO1YOR073W 1773 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 SPO23YBR250W 1572 nt0.83□□□□□ -2.28
AVT2P39981 APL3YBL037W 3078 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
AVT2P39981 WIP1YDR374W-A 270 nt0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms