Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ZEB1P37275 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZEB1P37275 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms