Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH11P35749 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYH11P35749 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYH11P35749 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MYH11P35749 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYH11P35749 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYH11P35749 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms