Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFTPDP35247 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms