Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RCVRNP35243 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms