Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPOP30536 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPOP30536 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms