Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB2P29033 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB2P29033 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB2P29033 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB2P29033 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GJB2P29033 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms