Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
PTPRMP28827 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRMP28827 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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