Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLD1P28340 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD1P28340 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD1P28340 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD1P28340 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD1P28340 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLD1P28340 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD1P28340 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLD1P28340 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLD1P28340 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLD1P28340 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLD1P28340 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms