Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMLP26374 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMLP26374 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMLP26374 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMLP26374 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMLP26374 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMLP26374 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMLP26374 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMLP26374 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms