Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYT1P21579 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYT1P21579 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYT1P21579 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYT1P21579 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYT1P21579 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYT1P21579 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms