Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRHP20396 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRHP20396 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRHP20396 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRHP20396 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRHP20396 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRHP20396 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRHP20396 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRHP20396 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRHP20396 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRHP20396 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRHP20396 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRHP20396 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRHP20396 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TRHP20396 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRHP20396 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRHP20396 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRHP20396 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRHP20396 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TRHP20396 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRHP20396 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRHP20396 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRHP20396 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms