Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TFE3P19532 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TFE3P19532 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TFE3P19532 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFE3P19532 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TFE3P19532 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TFE3P19532 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TFE3P19532 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms