Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP2A2P16615 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2A2P16615 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms