Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FDPSP14324 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FDPSP14324 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FDPSP14324 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDPSP14324 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDPSP14324 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FDPSP14324 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FDPSP14324 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FDPSP14324 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FDPSP14324 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FDPSP14324 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDPSP14324 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FDPSP14324 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms