Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT13P13646 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT13P13646 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT13P13646 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT13P13646 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT13P13646 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT13P13646 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT13P13646 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms