Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CFTRP13569 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CFTRP13569 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CFTRP13569 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CFTRP13569 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CFTRP13569 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CFTRP13569 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms