Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GP1BBP13224 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GP1BBP13224 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms