Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RLBP1P12271 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RLBP1P12271 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms