Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
LAMC1P11047 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LAMC1P11047 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms