Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD8BP10966 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD8BP10966 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD8BP10966 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD8BP10966 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD8BP10966 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8BP10966 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8BP10966 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD8BP10966 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms