Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRFP10586 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRFP10586 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms