Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMIGD3P0DMS9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms