Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms