Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM6P0DI80 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM6P0DI80 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms