Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRGC1P0CF51 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRGC1P0CF51 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms