Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM228BP0C875 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM228BP0C875 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms